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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
05/03/2008 |
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Data da última atualização: |
06/03/2008 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
VESPERO, E. C.; BARCELLOS, F. G.; PENHA, R. E. S.; PERUGINI, M. R. E.; CUNHA, M. H.; SARIDAKIS, H. O. |
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Afiliação: |
Eliana Carolina Vespero, UEL; Fernando Gomes Barcellos, UEL / CNPSo; ;Rafael Elias da Silva Penha, UEL; Marcia Regina Eches Perugini, UEL; Mariangela Hungria da Cunha, CNPSo; Halha Ostrensky Saridakis, UEL. |
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Título: |
Comparação de métodos moleculares utilizados no estudo epidemiológico de isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae produtora de esbl. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 24., 2007, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2007. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Nome correto do quinto autor HUNGRIA, M. |
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Conteúdo: |
Diferentes técnicas de tipagem para a espécie de Klebsiella pneumoniae tem sido relatadas com a finalidade de determinar se os isolados são geneticamente relacionados.Dentre os métodos moleculares genotípicos utilizados na diferenciação de amostras de K.pneumoniae destacam-se os seguintes: análise do perfil plasmidial, técnica de rep-PCR e RAPD, ribotipagem, PFGE AFLP. Este trabalho foi realizado com 141 amostras de K.pneumoniae produtoras de ESBL isoladas de pacientes do Hospital Universitário da Universidade Estadual de Londrina, no período de cinco anos (2000-2004), com o objetivo de entender a epidemiologia desta bactéria e avaliar as técnicas de rep-PCR, RAPD e PFGE utilizadas na tipagem molecular de K. pneumoniae. Foram utilizados os seguintes primers para as técnicas baseadas em PCR: ERIC1R, ERIC2, REP1R, REP2I, BOXA1R e o primer 793 para RAPD. Para a técnica de PFGE, o DNA cromossomal das bactérias foram digeridos com XbaI (Invitrogen) e os fragmentos de DNA foram separados usando o sistema CHEF-DRIII (Biorad, USA). Os géis foram analisados no programa Bionumerics (version 2.0; Applied Mathematics Kortrijk, Belgium) e a capacidade de discriminação de cada método foi calculado, utilizando o índice de Simpson ou de discriminação (DI). O índice de Simpson demonstrou poder elevado de discriminação com PFGE (DI=0,990), REP-PCR (DI=0,969) e com a combinação dos métodos (DI=0,999); seguidos de RAPD (DI=0,946), ERIC-PCR (DI=0,938) e BOX-PCR (DI=0,937). As técnicas baseadas em PCR tem sido frequentemente utilizada nos estudos epidemiológicos hospitalares por serem rápidas, baratas e de fácil execução. Embora o método de PFGE foi mais discriminatório, os métodos baseados em PCR mostraram -se mais eficientes na separação dos clones. De acordo com os resultados, os métodos baseados em PCR são apropriados para análise de diversidade de K.pneumoniae quando usados incialmente e PFGE como análise complementar, para confirmar a disseminação de uma cepa epidêmica. MenosDiferentes técnicas de tipagem para a espécie de Klebsiella pneumoniae tem sido relatadas com a finalidade de determinar se os isolados são geneticamente relacionados.Dentre os métodos moleculares genotípicos utilizados na diferenciação de amostras de K.pneumoniae destacam-se os seguintes: análise do perfil plasmidial, técnica de rep-PCR e RAPD, ribotipagem, PFGE AFLP. Este trabalho foi realizado com 141 amostras de K.pneumoniae produtoras de ESBL isoladas de pacientes do Hospital Universitário da Universidade Estadual de Londrina, no período de cinco anos (2000-2004), com o objetivo de entender a epidemiologia desta bactéria e avaliar as técnicas de rep-PCR, RAPD e PFGE utilizadas na tipagem molecular de K. pneumoniae. Foram utilizados os seguintes primers para as técnicas baseadas em PCR: ERIC1R, ERIC2, REP1R, REP2I, BOXA1R e o primer 793 para RAPD. Para a técnica de PFGE, o DNA cromossomal das bactérias foram digeridos com XbaI (Invitrogen) e os fragmentos de DNA foram separados usando o sistema CHEF-DRIII (Biorad, USA). Os géis foram analisados no programa Bionumerics (version 2.0; Applied Mathematics Kortrijk, Belgium) e a capacidade de discriminação de cada método foi calculado, utilizando o índice de Simpson ou de discriminação (DI). O índice de Simpson demonstrou poder elevado de discriminação com PFGE (DI=0,990), REP-PCR (DI=0,969) e com a combinação dos métodos (DI=0,999); seguidos de RAPD (DI=0,946), ERIC-PCR (DI=0,938) e BOX-PCR (DI=0,937). As técnicas baseadas ... Mostrar Tudo |
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520 $aDiferentes técnicas de tipagem para a espécie de Klebsiella pneumoniae tem sido relatadas com a finalidade de determinar se os isolados são geneticamente relacionados.Dentre os métodos moleculares genotípicos utilizados na diferenciação de amostras de K.pneumoniae destacam-se os seguintes: análise do perfil plasmidial, técnica de rep-PCR e RAPD, ribotipagem, PFGE AFLP. Este trabalho foi realizado com 141 amostras de K.pneumoniae produtoras de ESBL isoladas de pacientes do Hospital Universitário da Universidade Estadual de Londrina, no período de cinco anos (2000-2004), com o objetivo de entender a epidemiologia desta bactéria e avaliar as técnicas de rep-PCR, RAPD e PFGE utilizadas na tipagem molecular de K. pneumoniae. Foram utilizados os seguintes primers para as técnicas baseadas em PCR: ERIC1R, ERIC2, REP1R, REP2I, BOXA1R e o primer 793 para RAPD. Para a técnica de PFGE, o DNA cromossomal das bactérias foram digeridos com XbaI (Invitrogen) e os fragmentos de DNA foram separados usando o sistema CHEF-DRIII (Biorad, USA). Os géis foram analisados no programa Bionumerics (version 2.0; Applied Mathematics Kortrijk, Belgium) e a capacidade de discriminação de cada método foi calculado, utilizando o índice de Simpson ou de discriminação (DI). O índice de Simpson demonstrou poder elevado de discriminação com PFGE (DI=0,990), REP-PCR (DI=0,969) e com a combinação dos métodos (DI=0,999); seguidos de RAPD (DI=0,946), ERIC-PCR (DI=0,938) e BOX-PCR (DI=0,937). As técnicas baseadas em PCR tem sido frequentemente utilizada nos estudos epidemiológicos hospitalares por serem rápidas, baratas e de fácil execução. Embora o método de PFGE foi mais discriminatório, os métodos baseados em PCR mostraram -se mais eficientes na separação dos clones. De acordo com os resultados, os métodos baseados em PCR são apropriados para análise de diversidade de K.pneumoniae quando usados incialmente e PFGE como análise complementar, para confirmar a disseminação de uma cepa epidêmica.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
06/10/2006 |
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Data da última atualização: |
15/10/2009 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
Internacional - A |
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Autoria: |
MACHADO, E. C.; OLIVEIRA, R. F. de; RIBEIRO, R. V.; MEDINA, C. L.; STUCHI, E. S.; MARIN, F. R.; SILVA, J. A. B. da; SILVA, S. R. da. |
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Título: |
Fluxo de seiva e fotossíntése em laranjeira 'Natal' com clorose variegada dos citros. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v.41, n.6, p.911-918, jun. 2006. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da clorose variegada dos citros (CVC), no fluxo de seiva, trocas gasosas e atividade fotoquímica em laranjeira 'Natal', com e sem CVC, em condição de campo. O curso diário do fluxo de seiva, potencial da água na folha, assimilação de CO2, transpiração, condutância estomática e eficiência quântica máxima e efetiva do fotossistema II foram avaliados. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com cinco repetições. O fluxo de seiva foi 1,9 vez superior nas plantas sadias em relação às doentes. Em plantas doentes ocorreu queda de 43, 28 e 33% na assimilação de CO2, condutância estomática e transpiração, respectivamente. As plantas com CVC apresentaram fotoinibição dinâmica. Uma vez que a eficiência quântica efetiva apresentou um padrão de resposta semelhante, durante o dia, em ambos os tratamentos, o efeito protetor da fotorrespiração no aparato fotoquímico em plantas com CVC é discutido. As quedas de assimilação de CO2, transpiração e de fluxo de seiva, nas plantas com CVC, foram decorrentes do menor valor da condutância estomática, possivelmente causado pela colonização dos vasos do xilema pela Xylella fastidiosa. |
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Palavras-Chave: |
assimilação de CO2; assimilation; chlorophyll fluorescence; condutância estomática; fluorescência da clorofila; transpiração; Xilella fastidiosa. |
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Thesagro: |
Citrus Sinensis; Xylella Fastidiosa. |
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Thesaurus NAL: |
stomatal conductance; transpiration. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/11293/1/41n06a03.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/AI-SEDE/36244/1/41n06a03.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da clorose variegada dos citros (CVC), no fluxo de seiva, trocas gasosas e atividade fotoquímica em laranjeira 'Natal', com e sem CVC, em condição de campo. O curso diário do fluxo de seiva, potencial da água na folha, assimilação de CO2, transpiração, condutância estomática e eficiência quântica máxima e efetiva do fotossistema II foram avaliados. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com cinco repetições. O fluxo de seiva foi 1,9 vez superior nas plantas sadias em relação às doentes. Em plantas doentes ocorreu queda de 43, 28 e 33% na assimilação de CO2, condutância estomática e transpiração, respectivamente. As plantas com CVC apresentaram fotoinibição dinâmica. Uma vez que a eficiência quântica efetiva apresentou um padrão de resposta semelhante, durante o dia, em ambos os tratamentos, o efeito protetor da fotorrespiração no aparato fotoquímico em plantas com CVC é discutido. As quedas de assimilação de CO2, transpiração e de fluxo de seiva, nas plantas com CVC, foram decorrentes do menor valor da condutância estomática, possivelmente causado pela colonização dos vasos do xilema pela Xylella fastidiosa.
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653 $atranspiração
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700 1 $aSTUCHI, E. S.
700 1 $aMARIN, F. R.
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700 1 $aSILVA, S. R. da
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv.41, n.6, p.911-918, jun. 2006.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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